Работал таможенником в родном городе Абвиле. Принимал участие в создании местного музея. В речных отложениях на берегу реки Соммы обнаружил останки вымерших животных вместе с обработанными человеком каменными орудиями. В 1857 году он выпустил книгу «Кельтские и допотопные древности» (Antiquit?s celtiques et ant?diluviennes), и в 1860 — «Допотопный человек и его труды» (De l’Homme ant?diluvien et de ses ?uvres). Буше де Перт пришёл к выводу, что возраст человека на Земле гораздо древнее, чем представляет традиционная библейская хронология. Последующие находки подтвердили выводы Буше де Перта; он считается основоположником археологии, прежде всего археологии каменного века.