Имя от рождения — Яаков бен Иехуда Лейб (Лейбович). Получил начальное образование в Черновцах, а потом жил в Бухаресте. Признавался в нехватке образования, позднее теоретические дискуссии вели раввины из его секты, он сам в диспутах не участвовал.
Предположительно, его отец был саббатианцем и из-за преследований вынужден был переселиться в Валахию. Ещё в юном возрасте стал заниматься торговлей, разбогател, в 1752 женился на дочери богатого торговца из Никополя.
Посещая Турцию, стал контактировать с местными саббатианцами (дёнме). В Смирне Якоб встретился с хахамом Иссахаром, который посвятил его в саббатианство. Он и получил прозвище Френк (Франк), означающее выходца из Европы.
В 1740 году умер Берахии Руссо, община дёнме в Салониках лишилась лидера. Уже тогда он с одобрения Иссахара объявил себя реинкарнацией Берахии Руссо. Прослеживая переселение душ, он выстроил цепочку переселения душ - Мухаммад, Шабтай Цви, Берахии Руссо, в конце этой цепи он ставил себя. Чтобы доказать "подлинность" своей души, он начинает публично нарушать еврейские заповеди. Однако он от этого серьёзно напугал турецких евреев (и также дёнме), и был вынужден скрыться от преследований в Польше.
Возвратился в Подолию в 1755 году; объявил себя воплощением Шабтая Циви; был взят под покровительство католическим епископом Подолии Николаем Дембовским. Участвовал в ряде диспутов с раввинами, организованными католическим духовенством; доказывал действительность использования крови иудеями в ритуальных целях, что впоследствии использовалось как свидетельство в имевшей широкое хождение книге Гауденция Пикульского.
Ему удалось объединить и сплотить большую общину. Следуя за Берахией Руссо, он организовывал экстатические собрания, на которых происходили "ритуальные" нарушения запретов Торы, в том числе сексуальных заповедей.
27 января 1757 сектанты были арестованы за то, что они проводили религиозную оргию во время ярмарки в Лянцкоруне. Франк выставил себя подданным Турции и был освобождён из-под следствия, которое вели местные раввины. Он поселился в Хотине, который был тогда на территории Турции недалеко от польской границы.
Франкистская община 13 июня была изгнана в Бродах, затем во Львове, Луцке, Дубно и в Староконстантинове. Однако дело об оргиях, как имеющее отношение к религии, должно было разбираться в церковном суде, и Франк стал устанавливать контакты с католической церковью, ища покровительства. Он проработал саббатианские догматы, ввёл понятие Святой Троицы и выставил перед епископом дело так, что группа евреев борется против засилья талмудистов за признание Мессии и Троицы.
Епископ Каменец-Подольского Николай Дембовский (польск. Miko?aj Dembowski) потребовал, чтобы ортодоксальные евреи сформулировали обвинения против франкистов, а от последних потребовал изложить свое вероучение. Летом 1757 г. в Каменец-Подольском состоялися долгий диспут, на котором раввины, сторонники Якоба Франка заявил, что «Мессия никогда не придет, а Иерусалим никогда не будет отстроен». Кроме того франкисты высказались против Талмуда, считая истинной книгу Зохар. Ортодоксальные раввины вынуждены были оправдываться, доказывая, что Талмуд не оскорбляет христианство, а книга Зохар не противоречит Талмуду, не трогая других вопросов, считая их неуместными. Епископ назвал сторонников Якоба Франка победителями спора.
17 октября 1757 в Каменец-Подольском епископский суд во главе с Дембовским вынес приговор еврейской общине Лянцкоруна и обязал выплатить франкистам пять тысяч злотых; с евреев был взят налог на нужды церкви в Каменец-Подольском, а Талмуд был объявлен книгой, подлежащей сожжению. Талмуды изымались полицией в сопровождении франкистов по домам раввинов, синагогам, хедерам, библиотекам, и свозились для сожжения на базарную площадь. Однако в процессе сбора и сожжения талмудов Николай Дембовский неожиданно умер. Эту смерть стали истолковывать как наказание за сожжение святых еврейских книг. Еврейские массы в то время ожесточились против франкистов. Против них же стали выступать и поляки. После ряда массовых выступлений преемник Дембовского не решился далее защищать секту.
После этого Франк и большое количество его последователей бежали в Турцию, где в 1757 приняли ислам, нем не менее они не пользовались поддержкой ни общин дёнме, ни еврейских общин, ни турецких властей, и вынуждены были скитаться между Турцией и Польшей.
В 1758 Франк получил разрешение короля Августа III вернуться в Польшу, где обосновался в небольшой деревне около Хотина. Там он создал секту наподобие христианского братства. Франкисты, вернувшиеся из Турции, поселились вокруг в нескольких деревнях на берегу Днестра. Франк назначил из членов "братствва" 12 апостолов. Секту охотно посещали саббатианцы из других городов, оставляя богатые подарки.
Франк снова стал вести переписку с королём и архиепископом, стремясь назначить второй диспут с раввинами. При этом он давал обещание принять христианство и разоблачить "ритуальные убийства" у евреев (о чём тогда распространяли слухи отдельные ксёндзы, вопреки запретам папы). В обмен на ожидаемое крещение он пытался выторговать земельные участки вдоль Днестра, но безуспешно.
Диспут согласился провести львовский каноник Стефан Микульский. На диспуте львовский раввин Хаим Коэн Раппопорт доказал безосновательность утверждения о ритуальных убийствах, и Микульский признал этот вопрос невыясненным, однако в теоретических спорах объявил победу франкистам..
По мнению исследователя франкизма Меира Балабана, причиной выхода франкистов с кровавым наветом было давление католических священников и месть раввинам, которые преследовали франкистов.
После диспута христианские власти стали жёстко настаивать на принятии крещения, и вся секта (от 500 до 1000 человек) приняла христианство во Львове, 17 сентября 1759 года. Новые христиане принимали звания своих крестных отцов, тем самым попадая в среду польского дворянства. Сам Франк провёл две церемонии крещения, на последней в Варшаве его крестным отцом был сам король Август III; при этом присутствовали министры и дворяне, при крещении он получил имя Иосиф. За 30 лет количество крещёных евреев составляло около 25000
После принятия христианства Франк постарался сплотить секту, запретив браки с посторонними (как было в группах дёнме), и ввёл внутри секты собственные порядки.
В целом польское общество восприняло новокрещённых евреев достаточно благосклонно.
Якоб Франк подал ходатайство о предоставлении секте земельных участков. К секте с подозрением отнёсся папский нунций. Было произведено расследование деятельности секты, вскрыли переписку Якоба Франка с женой, и был сделан вывод, что вера сектантов несовместима с христианством. Следствие выяснило, что новокрещённые признают мессией самого Франка, исполняют свои собственные обряды. Виноватым был признан лично Франк, который намеренно вводил в заблуждение общину, он был арестован и в феврале 1760 посажен в крепость в Ченстохове.
Заключение было достаточно мягким, он мог встречаться с семьёй и с приверженцами, за время заключения он сформировал свой учение. Он рассылал общинам призывы принимать католицизм, которые находили резонанс в саббатианских общинах Моравии и в Чехии. Ореол мученика добавлял ему сторонников.
Крепость находилась в непосредственной близости от места паломничества к знаменитой Ченстоховской Божьей Матери, что сильно повлияло на Якоба Франка. За время заключения он сформулировал положение о соответствии Божьей Матери и шхины, а также о значении жены Мессии (он имел ввиду Шабтая Цви, Берахию Руссо и себя), потом воплощением Божьей Матери и Шхины стала его дочь Ева Франк.
В крепости он отработал текст "красных писем" (то есть писем, написанных красными чернилами), которые стали рассылаться по еврейским общинам с призывами принять христианство.
В 1767 русские войска вошли в Польшу, что сопровождалось восстанием гайдамаков и жестокими еврейскими погромами. Франк пытался наладить контакты с представителями православного духовенства, обещая массовый переход в православие, но не добился успеха. Франк не прекращал агитацию, объясняя несчастья евреев их несогласием принять новую веру, и выдавал мрачные прогнозы.
Барух Яван, противник Франка, связался тогда с русским православным духовенством и терпеливо объяснил им про деятельность Франка, от чего просьбы франкистов были проигнорированы.
В августе 1772 русские войска заняли Ченстохову, Франк был отпущен на свободу. Франк с семьёй направился в Варшаву. Выйдя из заключения, он оказался очень богатым - точная причина его богатства не выяснена, по одним предположениям он получил деньги от русских за шпионскую деятельность в пользу России, но скорее всего - от франкистов, которые при дворе в Варшаве сделали карьеру, получили дворянство, перестали вести агитационную деятельность, но охотно жертвовали деньги, которые собирала его дочь Ева Франк.
Далее Якоб направился в Брно, где снова стал организовывать общину - теперь уже не братство, а войско, состоящее из «казаков, улан и гусар». При этом он постоянно искал поддержку австрийских властей и получил даже аудиенцию у императора Иосифа II. Он пытался добиться титула графа, но безуспешно, хотя его дочь Ева стала пользоваться покровительством двора, находясь в интимной связи с императором. В 1788 году он получает титул барона.
В последние годы он жил в Оффенбахе, где он снял замок у графа Эрнста фон Гомбург-Бирнштейна за три миллиона гульденов, и стал именоваться «бароном Оффенбаха». К нему приезжали его приверженцы на паломничество и жертвовали большие суммы. Перед смертью в 1790 он собрал своих друзей, устроив большое празднество, были собраны крупные суммы денег в его пользу. При этом он старался не афишировать своё происхождение среди соседей, и выставлял себя как польский барон. Среди жителей города, поражённых роскошью, ходили слухи, что Франк - лично императр России Пётр III, а Ева - Елизавета Петровна; ходили и более скромные слухи о том, что Ева - внучка или дочь императрицы. Его состояние оценивалось в 800 тыс. дукатов.
Похоронен на католическом кладбище Оффенбаха, однако по еврейскому обряду. Похороны были обставлены с большой помпезностью и надолго запомнились жителям Оффенбаха. Руководство сектой перешло к его дочере Еве. Секта, однако, резко теряла популярность, Ева попала в серьёзные долги, а после смерти Евы в 1816 секта быстро сошла на нет.
В Польше небольшая группа франкистов существовала вплоть до конца XIX века.
Франк сформулировал три основных положения:
Община франкистов называлась «братством», в ней было 12 «апостолов» и 12 «сестер». Хотя Франк считал себя Мессией, он называл себя посланником «Великого Брата». Иисус Христос был лишь оболочкой «святого плода», а собственно плодом Франк считал самого себя. Переход в христианство он рассматривал как снятие ложной оболочки с иудаизма — включая талмудические законы и запреты.
Свое учение он назвал новой религией, «святой верой Эдома». Освобождение пленных искр и их возрождение должно достигаться при помощи оргиастической практики, вызывающей слияние мужского и женского начал Божества. При этом предписания иудаизма, по его мнению, утратили свою силу.
В своих притчах он обращается к образу библейского Исава, у которого его брат Иаков хитростью отнял первородство; он считает, что Исав своей праведностью и добротой не заслужил такого обмана. Так как потомки Исава ассоциируются с христианами. Принятие христианства Якоб Франк трактует как воздаяние дани по поводу несправедливого инцидента с первородством Исава.
Сохранились сочинения самого Франка, записанные под диктовку на языке идиш и переведённые на другие языки, преимущественно на польский.. В коротких притчах Якоб рассказывает об эпизодах, в которых он действует как "простак" (польск. prostak) - бесшабашно и напролом, и высшие силы помогают ему. В историях проглядывается символизм. Некоторые истории построены по схеме польских и русских народных сказок. Некоторые истории содержат толкования снов. Исследователь и переводчик Якоба Франка, проф. Гаррис Леновиц отмечает, что с точки зрения психоанализа сны иногда производят впечатление искусственных.
Отношение к франкизму среди других евреев было крайне отрицательное, идеи франкистов почти не оставили следов в религиозной мысли. При этом во времена подъёма франкизма появился хасидизм - движение, которое переосмыслило каббалистические проблемы, поднятые саббатианцами, и нашло решение, альтернативное франкизму.