После публичного доноса В.Столетова в «Правде» пал старейшей агроном страны, знаток земель юго-востока академик Н. М. Тулайков, вместе с Мейстером был расстрелян в Саратовской тюрьме.
В. Н. Столетов внёс вклад в реабилитацию генетики. Не желая вступать в прямой конфликт с Хрущёвым, который симпатизировал Лысенко, Столетов инициировал широкую дискуссию между сторонниками и противниками Лысенко, которая привела к публикации большого количества работ по генетике, что ранее было невозможно.
В педагогике Столетов выступал с консервативными взглядами, отстаивая первичность социальных факторов по отношению к врождённым, и в то же время был известен тем, что оказывал содействие педагогам-новаторам (в частности, о нём с благодарностью писал в своих воспоминаниях С. Л. Соловейчик ).
Кандидат в члены ЦК КПСС (1952—1956).