Окончил арабское отделение Восточного факультета Ленинградского университета (1955); кандидатская диссертация на тему «Видовременные отношения в системе личных форм арабского глагола» (1961). Докторская диссертация на тему «Проблемы деривационной синтаксической теории и вопросы синтаксиса арабского языка» (1973). С 1961 — в Институте лингвистических исследований РАН, сотрудник группы структурно-типологического изучения языка (под рук. А. А. Холодовича); главный научный сотрудник (с 1991), руководитель группы (с 1971), впоследствии Лаборатории типологического изучения языков. Также преподаёт на Восточном и филологическом факультетах СПбГУ.
Основные работы — по грамматической системе арабского языка и типологии глагольных категорий; внёс существенный вклад в описание залоговых конструкций в языках мира и понимание грамматической природы залога. Автор (совм. с А. П. Володиным) первого масштабного типологического описания категории императива. Под руководством В. С. Храковского было подготовлено большое количество изданий — в том числе 6 коллективных сборников, содержащих результаты типологического исследования различных глагольных категорий в соответствии с программой Петербургской типологической школы.