В органах МВД СССР работал с 1978 года. Имеет высшее юридическое образование. В 1988 году окончил Московскую высшую школу милиции МВД СССР (ныне Московский университет Министерства внутренних дел Российской Федерации).
С 1988 года по 1996 год — старший следователь по особо важным делам в 1-м районном управлении внутренних дел Центрального административного округа Москвы, затем с 1996 по 2000 гг. — заместитель начальника следственного отдела этого управления.
Назначен на должность судьи Хамовнического районного суда г. Москвы указом Президента РФ В. В. Путина от 15.07.2000 № 1322. К исполнению своих обязанностей приступил 4 августа 2000 года.
В период с октября 2004 года по ноябрь 2006 года исполнял обязанности председателя Хамовнического районного суда г. Москвы. Указом Президента РФ № 1328 от 30 ноября 2006 года назначен на должность председателя этого же суда.
30 декабря 2010 года Виктор Данилкин признал М. Ходорковского и П. Лебедева виновными по статьям 160 и 174 часть 1, по второму делу ЮКОСа, и постановил приговорить их к 13,5 годам заключения.