Иван Васильевич Вернадский закончил Киевский университет св. Владимира, несколько лет изучал политическую экономию за рубежом. Несколько лет преподавал русскую словесность в гимназии , заведовал кафедрой политэкономии в Киевском университете, после бракосочетания с дочерью известного русского экономиста Николая Шигаева — Марией молодая семья переехала в Москву. Там Иван Васильевич преподавал политэкономию и статистику в Московском университете. После переезда в Петербург Вернадский занимал должность профессора Главного педагогического института.
Издавал журнал «Экономический указатель». Действительный член Императорского русского географического общества (отделение статистики). С 1858 г. член Лондонского статистического общества (с 1887 г. — Королевское статистическое общество). Принимал участие в организации и проведении IV Международного статистического конгресса в Лондоне (июль 1860 г.)
Первая жена через десять лет после бракосочетания умерла, оставив ему сына Николая. Во второй раз Иван Васильевич женится на её двоюродной сестре — дочери украинского помещика Анне Петровне Константинович, учительнице музыки и пения.
В селе (Великие) Шишаки на Полтавщине у Вернадских была усадьба, куда они почти ежегодно на лето приезжали всей семьей.