Он устроился в PARC в качестве исследователя в августе 2006 года, также возглавлял отдел исследований в компании Packet Design в соседствующем с Xerox комплексе. До этого возглавлял отдел исследований в Cisco Systems и группу в области исследований сетей (Network Research Group) в Национальной лаборатории им. Лоуренса в Беркли.
Якобсон прежде всего известен своей работой над производительностью и масштабируемостью сетей на базе IP-протокола; его работа по редизайну алгоритмов контроля потоков TCP/IP (см. Алгоритм Якобсона) для лучшего управления перегрузками помогла сети Интернет избежать коллапса при значительном росте трафика в 1988—1989 гг. Также известен благодаря протоколу сжатия заголовков (TCP/IP Header Compression protocol), описанному в RFC 1144, который главным образом был нацелен на улучшение производительности на низкоскоростных соединениях. Протокол больше известен как Метод сжатия заголовков TCP/IP Ван Якобсона. Кроме того, он стал одним из соавторов нескольких широкоиспользуемых инструментов для диагностики сетей, как например, traceroute, pathchar и tcpdump.
За свою работу Якобсон в 2001 году получил награду SIGCOMM Award от Ассоциации вычислительной техники (ACM), в 2003 году — награду Премию в области компьютеров и коммуникаций имени Кодзи Кобаяши от Института инженеров электротехники и электроники (IEEE), а также был избран в Национальную инженерную академию в 2006 году.
В январе 2006 года на конференции Linux.conf.au Якобсон представил новую идею об улучшении производительности сетей, которая с того времени стала упоминаться как сетевые каналы (network channels).
Якобсон обсуждал свои идеи о Content-centric networking в августе 2006 в рамках программы Google Tech Talks . Это и является основной задачей его работы в PARC.