Родился в семье учителя исправительного дома. Его брат погиб на Первой мировой войне. Посещал народные школы в Кульмбахе и Лихтенау. В 1920 г. окончил гуманитарную гимназию в Кайзерлаутерне и в том же году поступил в Мюнхенский университет, где изучал индологию, которой, по некоторым данным, увлёкся ещё будучи учеником гимназии. Помимо индологии посещал лекции по философии, литературе, общему и сравнительному религиоведению, индогерманскому языкознанию, геополитике. Был полиглотом, владел готским, древнескандинавским, рядом диалектов немецкого, хинди, санскритом и пали. В 1926 г. защитил докторскую диссертацию на тему «К вопросу истории древнеиндийского стихосложения». С 1926 г. доцент, с 1927 г. преподавал историю индийской литературы, историю, языки и палеографию Древней Индии. Написал ряд статей по своей специализации для энциклопедического словаря Брокгауза. С 1932 г. профессор.
В 1935 г. занял место декана философского факультета Мюнхенского университета. В 1936 г. вступил в СС и уже в следующем году был приглашён занять пост президента Общества Аненэрбе. Вскоре, однако, пост президента занял рейхсфюрер СС Генрих Гиммлер, а Вюст стал фактически исполнять функции директора и научного куратора общества. Одновременно возглавлял учебно-исследовательский отдел индогерманской арийской культуры и языков и отдел индогерманского арийского языкознания и культурологии. В 1941—1945 гг. ректор Мюнхенского университета. Был одним из ведущих учёных-приверженцев национал-социализма. Лично участвовал в расследовании дела подпольной группы Белая Роза, действовавшей в Мюнхенском университете.
Летом 1945 г. Вюст был арестован американской военной полицией. Находился в лагерях для интернированных в Моозбурге, Ландсберге и Дахау. 9 ноября 1949 г. приговорён главной судебной палатой Мюнхена к трём годам рабочих лагерей, однако избежал приговора, так как ему было засчитан предыдущий срок заключения. Был также лишён права свободно работать по специальности, позднее снова публиковался.