В сферу его исследований входят индоевропейские языки, уральские языки, алтайские языки, афразийские языки, математическая лингвистика (лексикостатистика и глоттохронология). Также активно интересуется историко-лингвистическими реконструкциями, включая гипотезы о прамировом языке, ностратической и дене-кавказской макросемьях.
В книге «Числительные» (Numerals) Блажек рассматривает названия числительных в различных неродственных языковых семьях Евразии и Африки.