Ю. Мехоффер изучал живопись сперва в краковской Школе изящных искусств у Яна Матейко, затем учился в венских университете и Академии художеств, в парижской Школе изящных искусств. Был выдающимся мастером художественной графики, офорта, акватинты, литографии. Был создателем большого количества произведений так называемой «бытовой графики»: книжных обложек и иллюстраций, виньеток, экслибрисов, орнаментов, плакатов и инициалов. Занимался проектированием товарных знаков, акций и банкнот. Создал много портретов, в том числе и исторических личностей.
Ю.Мехоффер известен также как автор оконных витражей в стиле Венский Сецессион в церквях Фрибура и Кракова, а также настенной живописи в армянской церкви Львова и в краковском Вавеле.
Ю. Мехоффер был одним из основателей Товарищества польских художников «Искусство».
В числе его учеников, среди прочих были Здислав Эйхлер, Винценты Драбик.