С 1809 года учился в гимназии Терезианской дворянской академии в Вене, в той же академии обучался на философском отделении, позднее учился в Варшавском университете (закончил со степенью магистра, 1820) и одновременно преподавал в Варшавском лицее математику и греческий язык. В 1821 году участвовал в конкурсе на место профессора философии в Виленском университете, освободившееся после смерти И. Г. Абихта. Конкурс выиграл в июне того же года (13 голосов за, 1 против), однако назначение на должность было подписано только в конце декабря 1822 года. Между тем Голуховский летом 1821 года совершил поездку в Париж, где представился попечителю Виленского университета князю Адаму Чарторыйскому, и совершенствовал свою философскую подготовку в Германии. В августе 1821 года в Гейдельбергском университете сдал экзамены summa cum laude и был удостоен учёной степени доктора философии. До конца года и в 1822 году пребывал в Эрлангене, где стал сначала учеником, а потом другом Шеллинга. Под его влиянием написал книгу „Die Philosophie in ihrem Verh?ltnisse zum Leben ganzer V?lker und einzelner Menschen“.
Из Германии Голуховский вернулся в Варшаву, где совершенствовался в естественных науках, и в Вильну прибыл в середине 1823 года. Вступительную лекцию читал 27 октября 1823 года; его лекции пользовались большим успехом, привлекая многочисленную разнородную публику. Это на фоне следствия, развёрнутого Н. Н. Новосильцевым по делу тайных студенческих обществ филоматов и филаретов, обратило на себя внимание властей. По распоряжению ректора лекции Голуховского в январе 1824 года были прекращены, а указом 14 марта 1824 года Голуховский был отправлен в отставку и выслан из Вильны (вместе с профессорами И. Даниловичем, И. Лелевелем и М. Бобровским).
В Варшаве принимал участие в деятельности Общества друзей науки (Towarzystwo Przyjaci?? Nauk), однако это вызвало неудовольствие наместника Царства Польского великого князя Константина. Не желая нанести вред обществу, Голуховский устранился от участия в нём и с 1826 года обосновался в деревне Гарбач под Опатовым. Заброшенное имение привёл в образцовое состояние. Во время восстания 1830—1831 года принимал участие в общественно-политической жизни Варашавы, затем вернулся в деревню, где и провёл, при редких отъездах за границу, остаток жизни. Умер в Гарбаче, похоронен в приходском костёле в Момине.
Философское образование получил в Гейдельберге и Эрлангене, где учился у Шеллинга. Взгляды сформировались под влиянием Шелллинга и характеризуются как идеалистические и иррационалистические. Теории общественного договора Голуховский противопоставлял концепцию общества как организма с определенной иерархией и неравенством частей. Нация рассматривалась как божественное творение с собственным национальным духом; задача философии понималась в выражении этого духа.
В 1840-е — 1850-е годы написал работы о крестьянском вопросе („O ch?opach“, „Kwestia w?o?cia?ska w Polsce oraz Rozbi?r kwestii w?o?cia?skiej w Polsce i w Rosji w r. 1850“). Главный философский труд „Dumanie nad najwy?szymi zagadnieniami cz?owieka poprzedzone historycznem rozwini?ciem g?ownych systemat?w filozoficznych od Kanta do najnowszych czas?w“ вышел посмертно (Вильно, 1861).