Юрий Иванович Шокин родился 9 июля 1943 года в городе Канск Красноярского края.
- С 1961 по 1966 год обучение на механико-математический факультете Новосибирского государственного университета.
- С 1969 года работал в Вычислительном центре АН СССР сначала в должности младшего, а затем старшего научного сотрудника, заведующего лабораторией.
- В 1976 году перешел в Институт теоретической и прикладной механики СО АН СССР.
- 26 июня 1981 присвоена учённая степень доктора физико-математических наук.
- С 1983 года — директор Вычислительного центра СО АН СССР. В настоящее время — директор Института вычислительных технологий СО РАН.
- В 1984 году избран членом-корреспондентом АН СССР по отделению информатики, вычислительной техники и автоматизации по специальности «Информатика». 17 февраля присвоено учённое звание — профессор.
- В 1990 г. по решению Президиума СО АН СССР создает Институт вычислительных технологий в котором были развернуты исследования по одному из самых современных научных направлений — информационно-вычислительным технологиям.
- В 1992—1997 годах — главный ученый секретарь СО РАН.
- В 1994 избран академиком РАН по отделению информационных технологий и вычислительных систем.
- В 1998 г. возглавил созданный указом Президента РФ научно-технологический парк «Новосибирск»
В настоящее время является членом Президиума РАН, Президиума СО РАН , бюро Отделения нанотехнологий и информационных технологий РАН , Рабочей группы 2.5 по математическому обеспечению численных расчетов ИФИП, постоянных программных комитетов ряда международных конференций, Американского общества механиков-инженеров, Национальной ассоциации бизнес-инкубаторов (США), Межрегиональной ассоциации руководителей предприятий и др.
Ю. И. Шокин — почетный профессор Евразийского (Астана, Республика Казахстан) и Харбинского (Китай) университетов, почетный академик Инженерной академии наук Республики Казахстан. Он входит в состав редколлегий ряда научных журналов: «Сибирский журнал вычислительной математики», «Сибирский журнал индустриальной математики», «Computational Fluids Dynamics Journal» (Япония), «Russian Journal of Numerical Analysis and Mathematical Modeling» (Нидерланды — Россия), «Computers & Fluids» (США и др.)
Ю. И. Шокин награжден орденом «Знак Почета», орденом Дружбы и орденом Почёта.