В молодости играл за футбольный клуб «Трактор» города Вегелебен (1961—1967). Потом был делегирован в «базу талантов» к 1. ФК Магдебург. С ФК Магдебург он три раза стал чемпионом ГДР и четыре раза стал победителем кубка ОСНП по футболу. В 1974 году он был членом магдебургской комады, которая победила в турнире обладателей Кубков УЕФА.
Померенке участвовал в 44 играх молодёжной сборной ГДР, с которой он в 1970 году победил в турнире УЕФА.
В 57 играх национальной сборной ГДР он забил 3 гола. В 1972 году его команда завоевала бронзовый медаль в олимпийском турнире. В 1974 году сборная с его участием попала в последный тур первенства мира.
В 1975 году любители футбола его избрали «Футболистом года» ГДР.
15 сентября 1984 года он участвовал в своём последнем игре за 1.ФК Магдебург. Проблемы с коленом вынудили его прощаться со спортом. За свою магдебургскую команду он в 15 сезонах участвовал в 301 игре в Оберлиге, в 55 играх за кубок ОСНП и 48 играх за европейские кубки. В 404 играх он забил 147 голов.
В сборной ГДР Юрген Поммеренке дебютировал 31 мая 1972 года в товарищеском матче со сборной Уругвая, завершившимся ничьей со счётом 0:0. В том же году Поммеренке в составе сборной поехал в Мюнхен на XX летние Олимпийские игры, он сыграл во всех семи матчах своей команды которая стала бронзовым призёром и забил 1 гол в ворота сборной ФРГ. В 1974 году Поммеренке принял участие в единственном для своей страны чемпионате мира 1974 года, он сыграл в трёх матчах, включая первый матч со сборной Австралии. Своё последнее выступление за сборную Поммеренке провёл в товарищеском матче со сборной Финляндии 16 марта 1983 года, тот матч завершился победой восточных немцев со счётом 3:1. Всего же за сборную Юрген Поммеренке сыграл 53 официальных матча в которых забил 3 гола. Так же Поммеренке сыграл 7 матчей за олимпийскую сборную ГДР, в которых забил 1 гол.
Итого: 53 матча / 3 гола; 28 побед, 13 ничьих, 12 поражений.
Итого: 7 матчей / 1 гол; 4 победы, 1 ничья, 2 поражения.