После победы, одержанной британским флотом при Абукире, Томас Харди был назначен 4 августа 1798 года командиром 74-пушечного корабля «Вэйнгард» (англ. HMS Vanguard). В июне 1799 года назначен командиром 80-пушечного корабля «Фудройянт» (англ. HMS Foudroyant), на котором участвовал в высадке морского десанта в Неаполе и перевозке короля Фердинанда IV с семейством в герцогство Тосканское. 13 октября того же года назначен командиром 32-пушечного фрегата «Принсесс Шарлотт» (англ. Princess Charlotte), на котором вернулся в Англию.
После окончания наполеоновских войн, 4 января 1815 года, сэр Томас был награжден орденом Бани командорского креста. В 1825 году он был произведен в чин контр-адмирала синего флага. 23 июля 1830 года Харди был произведен в чин контр-адмирала белого флага, а в ноябре того же года был назначен первым морским лордом Адмиралтейства.
Несколько кораблей были названы в честь него HMS Hardy.