С 1902 года включился в деятельность ВМОРО. В 1903 г. был бойцом в отряде Николы Пушкарова, участвовал в Илинденском восстании.
Тодор Паница участвовал в заговоре Яне Санданского против руководства ВМОРО и убил 28 ноября 1907 г. заграничных представителей Организации в Софии поручика Бориса Сарафова и Ивана Гарванова, за что был приговорен к смерти на Кюстендильском конгрессе ВМРО в 1908 г.
Вместе с Санданским участвовал в Младотурецкой революции в 1908 г., после которой был амнистирован и жил в городе Драма. Участвовал в Балканских войнах (1912—1913) и в Первой мировой войне, в которой был ранен и за проявленный героизм награжден крестом за храбрость.
Тодор Паница был убит по решению ЦК ВМРО Мельпоменой Крничевой 8 мая 1925 г. в Бургтеатре (Вена).