Позднее работал в банках «Ленвнешторг», «Инкомбанк».
В 1994 году якобы арестован по подозрению в ограблении и признал вину (частично), провел 3 дня в тюрьме, был отпущен.
В 2004—2006 был женат на певице Заре. В 2008 женился второй раз на аспирантке Юлии, 6 апреля 2009 родилась дочь Арина.
В 2006 году Сергей якобы купил остров в Эстонии. В интервью КП он это отрицал с разъяснением.
В 2008 году С. Матвиенко отметил своё 35-летие в Юсуповском дворце, стоимость чего журналисты оценили в 50—60 тыс.евро
Согласно рейтингу журнала «Финанс», в 2011 году входил в список 500 российских миллиардеров (за № 486, капитал 4,9 млрд руб.).