Учился во ВГИКе на режиссёрском факультете. В 1931 году окончил МГУ9. С 1932 по 2001 год преподавал во ВГИКе, с 1953 года — профессор. На момент завершения преподавательской деятельности его педагогический стаж составил 70 лет.
Профессор Комаров выступал с лекциями в Эдинбурге, Лондоне, Париже, Нью-Йорке. Являлся членом жюри различных кинофестивалей.
Жена — Галина Владимировна Комарова.
Последние годы жизни провел в Доме ветеранов кино.
В 2005 году, на основе мемуаров Сергея Комарова был снят документальный фильм «Киновек Сергея Комарова». Режиссеры Марианна Кириева и Марина Труш. В фильме приняли участие: Наум Клейман — директор Музея кино, Сергей Лазарук — киновед, Вадим Абдрашитов и Марлен Хуциев — кинорежиссеры, Александр Новиков — ректор ВГИКа.