1983—1985, 1988—1990 — учился в Уральском университете (Свердловск) на математико-механическом, затем ? на экономическом факультете (выпускник 1992 г.) .
1985—1988: служил в соединении атомных подводных лодок на Северном флоте.
1990—1992 — учился на факультете экономики университета г. Марбурга (ФРГ).
1992—1994 — аудитор в BDO Binder (Франкфурт-на-Майне).
1994—1995 — директор RFI GmbH — Общества по консультированию по инвестициям в Россию, официального представителя РФФИ в Евросоюзе.
июнь 1995 — декабрь 1997 г. — научный сотрудник Института проблем инвестирования, руководитель управления внешних связей Всероссийского банка развития регионов.
1997—1999 — руководитель аналитического центра экономической стратегии Росэнергоатома.
1999—2001 — советник гендиректора ВНИИАЭС по экономической стратегии.
2002—2005 — председатель Государственного фонда конверсии.
2004 — окончил Высшие академические курсы Военной академии Генерального штаба Вооружённых Сил Российской Федерации по специальности «Оборона и обеспечение безопасности Российской Федерации».
февраль — июнь 2005 г. — советник председателя правления Газпромбанка, вице-президент ЗАО «Атомстройэкспорт».
Июнь 2005 — май 2008 — президент ЗАО «Атомстройэкспорт».
С 12 мая 2008 г. — министр энергетики России .
С 23 мая 2008 г. — Президент Электроэнергетического Совета СНГ .
С 17 июля 2008 г. — председатель совета директоров компании «Транснефть».
C 1 июля 2011 года Сергей Иванович Шматко вышел из состава совета директоров компании «Транснефть».. 30 июня 2011 года Маттиас Варниг избран в состав совета директоров компании «Транснефть» вместо Сергея Ивановича Шматко..