Губкин родился в Санкт-Петербурге в семье служащих. В 1928 он окончил Московскую горную академию, в 1930-48 работал в Московском институте цветных металлов и золота, заведовал кафедрой обработки металлов давлением. Одновременно в 1944-48 был заместителем директора Институте металлургии АН СССР, возглавлял отдел обработки металлов давлением в этом учреждении. В 1948 был приглашен на должность директора Физико-технического института АН БССР, основал и возглавил кафедру "Машины и технология обработки металлов давлением" в Белорусском политехническом институте.
Губкин подготовил 20 кандидатов наук.
Научные труды Губкина посвящены теории пластической деформации и обработки металлов давлением. Им были разработаны математические методы изучения процессов течения металла при прокатке, ковке, штамповке и т.д.; введено понятие о механических схемах деформации; создана классификация технологических процессов, исходя из их влияния на пластические свойства металлов.
Губкин является автором более 120 научных работ, среди которых: