Вероятно, Санахт был вельможей или дальним родственником II династии, который стал наследником фараона Хасехемуи благодаря женитьбе на его дочери (если следовать той логике, что престол в Древнем Египте передавался по женской линии ещё с начала династического периода). Не исключено, что он мог быть родным сыном последнего фараона II династии Хасехемуи и царицы Нимаатхеп.
Санахт одержал победу в районе медных рудников на Синайском полуострове над бедуинами, о чем свидетельствуют его надписи и изображения в районе современного Вади-Магкара, где Санахт изображён в обычной сцене триумфа. Царь в короне Нижнего Египта наносит удар пленному врагу, фигура которого не сохранилась. Далее опять изображён стоящий царь, с короной Верхнего Египта на голове. Перед ним штандарт бога Упуата и фигура священного сокола Хора.
В Бет-Халлафе, недалеко от Абидоса, находится большая мастаба из кирпича-сырца, с использованием известняка, в которой было обнаружено имя Санахта и останки, которые можно считать останками фараона. Манефон сообщает, что этот правитель (названный у него Месокрисом) был очень высоким.
Преемником Санахта был его брат, знаменитый Джосер, считающийся самым выдающимся фараоном Древнего царства. О деятельности Санахта, правившего 18 лет, нам практически ничего не известно, поэтому основателем Древнего царства иногда считается именно Джосер.