Родом из с. Ружина Владимирского повета (сейчас Волынская область Украины).
Отец — Михаил Ружинский — князь, казацкий полковник, украинский гетман в 1585 году.
Являлся потомком Великого князя литовского Гедимина. Такую характеристику дал ему польский геральдик Папроцкий:
Князь Богдан Ружинский стал известным сперва как начальник польской казацкой милиции, охранявшей границы Речи Посполитой. Поняв общность интересов как пограничных, так и низовых казаков, Ружинский подался на Днепр, и тут имя его, как смелого и мужественного атамана, скоро сделалось широко известным. Вести про нового казацкого предводителя дошли до Москвы. Московский государь Иван IV Грозный в 1575 году послав на Сечь царскую грамоту, в которой писал к «…голове, князю Богдану Ружинскому и ко всем козакам днепровским с великим своим жалованием и с приказом к ним», в которой предлагал им царскую службу и многие богатые подарки и посулы, в обмен на поход на крымские улусы и на Козлов (теперь Евпатория). Ружинский с казаками согласились на это предложение.
Богданко воспользовался случаем, когда татары, в октябре 1575 года, по повелению турецкого султана Амурата, мстившего Польше, одиннадцатитысячным войском бросились «на Русь», пожгли, захватили огромный полон из христиан и повели его на переправу через Днестр. С отборными воинами-казаками Богданко ворвался в татарские владения за Перекоп, опустошил Крым «огнем и мечом», освободил большое количество пленников из неволи. После похода на Крым Ружинский с низовыми казаками осуществил морской поход и, приставая к берегам Малой Азии, брал турецкие города, истребляя в них жителей. Так, он взял приступом Трапезунд (теперь Трабзон) и вырубил его население, потом овладел Синопом и разрушил его до основания, после чего подошел даже к Стамбулу (Константинополю) и «взял под ним многія корысти».
О причине фанатического озлобления Богданка против мусульман ни польские, ни малороссийские (украинские) источники не говорят. Существует лишь народная дума о Богданке, которая указывает на пленение татарами его жены и убийстве матери:
Ровно через сто лет после этого, как пишет «Летописи Самовидец», запорожские казаки вспоминали о славных походах Богданка и грозили повторить снова подобные походы на Крым.
Возвратившись из морского похода, Богдан Ружинский в 1575 году предпринял новый поход на турецкую крепость Аслам-город ( или Аслам-Кермен), построенную турками для преграждения выхода казакам в устье Днепра и в Черное море, и разрушил её до основания.
В 1576 году, штурмуя замок, Ружинский погиб во время подкопа при взрыве порохового заряда под крепостью.
Успешные походы Богданко дали ему возможность обратиться к новому королю Речи Посполитой Стефану Баторию с просьбой, узаконить существование Войска Запорожского и его права.
Стефан Баторий 20 августа 1576 года издал Универсал, которым подтвердил за Войском Запорожским все владения, захваченные казаками у татар.