Исполнительный директор Правозащитного центра Всемирного русского народного собора. Член Экспертного совета по проведению государственной религиоведческой экспертизы при Министерстве юстиции Российской Федерации.
В 1999 году закончил кафедру экономической и социальной географии России Географического факультета МГУ и поступил в аспирантуру Института этнологии и антропологии РАН
С июля 2001 года по декабрь 2005 года — исполнительный секретарь Межрелигиозного совета России.
В июне 2003 года в Институте этнологии и антропологии РАН защитил кандидатскую диссертацию по истории по теме «Этносоциальные, политические и религиозные аспекты раскола исламского сообщества России».
С марта 2004 года по 2006 год — секретарь-координатор Межрелигиозного совета СНГ. В это же время — сотрудник Отдела внешних церковных связей Московского патриархата.
В 2005 году была выпущена книга Романа Силантьева «Новейшая история исламского сообщества России», вокруг которой разгорелись бурные дебаты. Книга получила, как положительные отзывы со стороны представителей духовенства и общественности православия, ислама и иудаизма, а также учёных, в том числе и от Шейх-уль-ислама и Верховного муфтия Центрального духовного управления мусульман России Талгата Таджуддина, так и отрицательные со стороны Совета муфтиев России. После этого Силантьев покинул Межрелигиозный совет России и был освобожден от занимаемых должностей по собственному желанию.
С 2006 года является исполнительным директором программ Всемирного русского народного собора
В 2008 году выпустил энциклопедию «Ислам в современной России», которая получила высокие оценки, как со стороны мусульманского сообщества, так учёных-исламоведов — Ефима Резвана, Виталия Наумкина,Максуда Садикова и Тауфика Ибрагима
С 2008 года — доцент кафедры мировой культуры Институт международных отношений и социально-политических наук Московского государственного лингвистического университета.
С 2009 года — заместитель председателя Экспертного совета по проведению государственной религиоведческой экспертизе при Минюсте РФ.
В апреле 2010 года создал и возглавил Центр географии религий при Синодальном отделе по взаимоотношениям Церкви и общества.
Автор совместного проекта МГЛУ и Интерфакс-Религия «Интерактивная карта всех религиозных общин России» содержащую сведения о 25 тысячах действующих в России религиозных объединениях, их точном названии и местоположении. Участвовал в разработке и выпуске «Атласа исламского сообщества России» в котором содержится подробная информация о религиозном и этническом составе мусульманского сообщества России в целом и по каждому региону, описаны все действующие в стране централизованные исламские организации, а на более чем 50 картах нанесены все зарегистрированные мусульманские общины (более 4 тыс.) и духовные учебные заведения (около 100).
Выдающийся учёный, научный сотрудник отдела современной истории и социально-политических проблем стран ЦЮВЕ Института славяноведения РАН Г.Н Энгельгардт также положительно отозвался об этой работе:
Доктор исторических наук, замдиректора Кунсткамеры по научной работе Ефим Резван назвал энциклопедию Р.Силантьева
В свою очередь руководитель Центра арабских исследований Института востоковедения РАН Виталий Наумкин назвал книгу Р.Силантьева «важным явлением в нашей интеллектуальной жизни»:
Совет муфтиев России официально обвинил Силантьева в искажении фактов в его книгах об исламе:
Работы Силантьева вызывают критику и у ряда представителей исламоведческой науки. Так, философ и востоковед Ю.Г. Петраш высказался о слабых познаниях Силантьева в области исламоведения и не только об этом: