В 1973 году репутация Спитцера в научных кругах пошатнулась, когда он встал на сторону тех, кто не рассматривал гомосексуальность как клиническое нарушение психики, хотя впоследствии бо?льшая часть психиатрического сообщества примкнула к его точке зрения.
В своем официальном обосновании (англ.) решения АПА об исключении гомосексуальности из списка психических отклонений Спитцер, являвшийся в 1973 году членом спецкомитета АПА по номенклатуре и статистике, пишет:
Для того чтобы признать психическим нарушением какое-либо ментальное или психическое состояние, оно должно отвечать одному из двух требований: доставлять субъективное страдание или регулярно ассоциироваться с некоторым общим ухудшением в социальной эффективности или функционировании. [...] Только в одном аспекте гомосексуальность могла бы считаться психическим нарушением — в том, что гомосексуал не может вести гетеросексуальную половую активность, которая считается оптимальной в нашем обществе и среди многих наших коллег. Однако если мы примем, что несоответствие кого-либо оптимальной функциональности в некоторой жизненно важной сфере, рассматриваемое обществом или психиатрами, достаточно для того, чтобы признать наличие психического нарушения, тогда нам придется добавить к нашей номенклатуре и все следующие состояния: воздержание, целибат (отказ от оптимального сексуального функционирования), бунтарское поведение (иррациональное отрицание социальных норм), религиозный фанатизм (догматичное и неукоснительное следование религиозной доктрине), расизм (иррациональная ненависть к некоторым группам), вегетарианство (неестественный отказ от животной пищи), а также мужской шовинизм (иррациональную веру в изначальную неполноценность женщин).
В 2001 году на ежегодной конференции АПА Спитцер представил неоднозначную работу, утверждавшую, что люди «с сильной мотивацией» могут «с успехом» изменить свою сексуальную ориентацию с гомосексуальной на гетеросексуальную. Работа вызвала много споров и критики, а АПА немедленно выпустила официальную резолюцию, поставив результаты Спитцера под сомнение и указывая на то, что работа не была рецензирована и что «не существует опубликованных научных доказательств, подтверждающих эффективность репаративной терапии как средства для изменения сексуальной ориентации».
Два года спустя Спитцер опубликовал свою работу в издании «Archives of Sexual Behavior». Решение о публикации работы вызвало скандал, в результате которого один из спонсоров в знак протеста отказался в дальнейшем спонсировать это издание. Работу Спитцера раскритиковали по нескольким позициям, включая неслучайную выборку испытуемых и слишком нечёткий критерий для определения «успеха» терапии.
(неполная)