Начал карьеру в чемпионате Франции в Футбольном клубе Мец, где за шесть лет забил более 40 мячей, после чего переехал в Марсель, где выступал за клуб Олимпик Марсель. После ЧЕ-2000 года за 10 млн евро уехал в Арсенал к Арсену Венгеру.
Из-за травмы пропустил ЧМ-2002 в Южной Корее/Японии, на который возлагал большие надежды. Участник ЧЕ-2004. С позиции левого инсайда мог не только развивать атаки трехцветных, но и забивать. В составе Арсенала в последние годы считался одним из лучших атакующих полузащитников Европы. Предпочитает играть на флангах (обычно слева), нередко забивает.
В 2006 году покинул Арсенал, перебравшись в испанский Вильяреал.
Пирес играл в футболке Вильяреала до 2010 года. За время своего пребывания в клубе игрок провел на поле 102 матча, в которых забил 13 голов.
18 ноября 2010 года подписал рассчитанный до конца сезона контракт с английской Астон Виллой.
В настоящее время Пирес является свободным агентом, и ждёт предложений. В 2012 году планируется его участие в новой футбольной лиге Индии Premier League Soccer.