Окончив курс наук в Женеве, он отправился в Париж, где занимался под руководством Вебба. По совету последнего Буассье занялся специальным изучением испанской флоры, в то время (1836) ещё совершенно не изученной.
Результатом первого путешествия Буассье по Испании явилась в 1838 его первая большая работа «Elenchus plantarum novarum minusque cognitarum», в которой он, между прочим, описал 200 новых видов.
В 1839 Буассье начал издавать капитальный труд «Voyage botanique dans le mide de l’Europe pendant l’ann?e 1837», in 4°, оконченный в 1846.
В 1842, заинтересовавшись полученным из Афин гербарием, Буассье предпринял путешествие в Грецию, окрестности Константинополя и Малую Азию, а в 1845 и 1846 он посетил, вместе со своею женою, урождённой Lucile Butini (в честь которой им названы виды Celsia luciliae, Omphalodes luciliae и Chionodoxa luciliae), Египет, Аравию, Сирию и Палестину.
С 1849 несколько раз посещал Пиренейский полуостров, бывал в Альпах, в Германии, Австрии, Англии, Норвегии, Дании, Италии, Алжире и России, а в 1866 он путешествовал с дерптским профессором Бузе по Азиатской России и Персии.
В 1867 вышел первый том его знаменитого сочинения «Flora orientalis», последний, 5-й том которого был окончен в 1884, за год до смерти Буассье, последовавшей 1885. «Flora orientalis» заключает в себе подробное описание 11 876 видов, с указанием области их распространения, с ключами для определения видов. Этот труд является необходимым пособием для всякого, занимающегося флорою Востока.
Буассье описал сам всего 3 602 новых вида, а вместе с другими — ещё 2 338 видов. Им установлено 103 новых рода самостоятельно и 28 в сотрудничестве с другими, дано описание всего 18 496 видов, опубликовано 347 таблиц с 378 видами.
Отдельных работ его (отчасти в сотрудничестве с другими) имеется 21.
В виде отдыха Буассье занимался близ Женевы садоводством.