Павел Петрович Беньков родился в Казани 8 декабря (20 декабря по новому стилю) 1879 года. Окончил Петербургскую академию художеств, в которой учился у Д. Н. Кардовского с 1901 по 1906 годы. Продолжил своё образование в Париже в академии Жюлиана в 1906 году.
C 1909 по 1929 год П. П. Беньков преподавал живопись в художественных учебных заведениях Казани.
В 1929 году вступил в «Ассоциацию художников революционной России».
В 1930 году П. П. Беньков переехал в Самарканд и стал преподавать живопись в Самаркандском художественном училище, где воспитал целую плеяду узбекских художников, среди которых Абдулхак Абдуллаев. В 1939 году ему было присвоено звание Заслуженный деятель искусств Узбекской ССР.
В своих жанровых и исторических картинах, написанных в годы жизни в Узбекистане, а также портретах, П. П. Беньков красочно отобразил национальный колорит и быт людей, живущих в Узбекистане, природу края и архитектуру его городов. Его картины имеются во многих музеях Москвы, Ташкента и Самарканда, а также и в частных коллекциях.
Умер П. П. Беньков в Самарканде 16 января 1949 года.