В 1790 году поступил на русскую службу и был назначен подполковником Екатеринославского казачьего войска. Участвовал в штурме Измаила, в 1791 году сформировал полк из 800 человек (преимущественно арнаутов), названный левантским. Командовал малороссийским кирасирским полком. С 1797 года в отставке.
В 1806 году в связи с новой войной с Турцией вернулся в строй. В начале войны Кантакузен был назначен наказным атаманом Бугского казачьего, также сформировал 6 волонтёрских полков в Дунайских княжествах. В 1818 году Кантакузен получил чин генерал-майора, служил некоторое время по ведомству военных поселений и других, а в 1833 году вышел в отставку.