По окончании курса в Московской духовной академии Соколов Николай Кириллович был оставлен бакалавром по кафедре русской церковной истории (1858 год).
По возвращении из-за границы (1863 год) преподавал и западную церковную историю в Академии, и церковное право в Университете.
Несколько лет был также членом университетского суда и редактором «Университетских Известий».
Литературная деятельность Соколова была обширна и началась в 1859 году статьями:
За ними последовали:
Особенное впечатление произвели статьи Соколова Николая Кирилловича по вопросу о духовно-судебной реформе, в которых были указаны многие причины недостатков духовных судов и приведены способы их устранения, таковы:
В то же время Соколов Николай Кириллович написал:
В первой он вооружался против вторжения государственного чиновнического элемента в церковную жизнь, а во второй — против тех подделок под древние формы свободной церковной жизни, которые могут служить прикрытием начал и тенденций, чуждых свободному духу древней христианской церкви.
Статьи Соколова Николая Кирилловича о церковном суде вызвали, с одной стороны, сочувствие к нему известной части общества и св. синода, который даже руководился ими, и с другой — страстную полемику; как бы в ответ на нее он в конце 1871 года напечатал: «О разделении суда и администрации в епархиальном ведомстве» («Православное Обозрение», №№ 10—11), где старался главным образом уяснить собственные основные положения.
Однако, полемика продолжалась, и Соколов Николай Кириллович не пожелал более высказываться печатно по этому вопросу. Дальнейшие статьи его уже исторического характера: «Взгляд на церковную реформацию в Англии» («Прав. Обозр.», 1872, № 2) и «Судьбы папской системы церковного управления» (ib., 1872, № 11).
После смерти Соколова Н. К. вышли его: «Из лекций по церковному праву. Вып. I. Введение в церковное право. Вып. II. Система канонического права» (М., 1875).