С 11 апреля 1989 года председатель Синодальной комиссии по канонизации святых.
С 3 мая 1990 года в связи с кончиной Патриарха Пимена по 10 июня 1990 года и с 5 декабря 2008 года по 1 февраля 2009 года в связи с кончиной правящего епископа города Москвы Патриарха Алексия II управлял Московской (городской) епархией.
Родился 22 сентября 1935 года в Ярославле в семье служащих. Родственники со стороны отца были старообрядцами .
С 1946 состоял в числе прислуживающих в алтаре Ярославского кафедрального собора при ярославских архипастырях.
Окончил среднюю школу в Ярославле.
Религиозное воспитание осуществляла мать, бывшая духовной дочерью архиепископа Варлаама (Ряшенцева), которого она даже посещала в ссылке, затем священника Владимира Градусова (впоследствии архиепископ Ярославский).
После епископа Угличского Исаии (Ковалёва) его «постоянным духовным руководителем <…> до дня своей блаженной кончины» был, начиная со времени иеродиаконства Никодим (Ротов). Митрополиту Никодиму же он относит своё назначение в 1972 году председателем ОВЦС: «Думаю, что и он был уверен в последующие годы в моей преданности Церкви, ибо после перенесенного им первого инфаркта в 1972 году рекомендовал меня в качестве своего преемника на пост председателя Отдела внешних церковных сношений.»
В 1953 году поступил в Ленинградскую духовную семинарию, которую окончил по 1-му разряду.
В 1957 году поступил в Ленинградскую Духовную Академию.
10 октября 1959 года в Иоанно-Богословском храме при Ленинградской духовной академии пострижен в монашество архимандритом Никодимом (Ротовым) с именем Ювеналий, в честь святителя Ювеналия, патриарха Иерусалимского.
4 ноября 1959 года митрополитом Ленинградским и Ладожским Питиримом (Свиридовым) рукоположен во иеродиакона. 1 января 1960 года епископом Лужским Алексием (Коноплёвым) рукоположен во иеромонаха.
Никодим (Ротов), ставший в июле 1960 года епископом и председателем Отдела внешних церковных сношений, перевел иеромонаха Ювеналия в Москву, в связи с чем тот окончил Московскую духовную академию (1961).
7 июля 1962 года за усердное служение Святой Церкви Святейший Патриарх Алексий I наградил иеромонаха Ювеналия саном игумена с возложением креста с украшениями, а 14 июля — правом ношения палицы.
25 ноября 1965 решением Святейшего Патриарха Алексия I и Священного Синода архимандриту Ювеналию определено быть епископом Зарайским, викарием Московской епархии с оставлением в должности заместителя Председателя Отдела Внешних Церковных Сношений.
25 декабря 1965 года в Иоанно-Богословском храме Ленинградской Духовной Академии состоялось наречение, а 26 декабря в Троицком соборе Александро-Невской Лавры — архиерейская хиротония, которую возглавил митрополит Ленинградский и Ладожский Никодим, Председатель Отдела внешних церковных сношений.
20 марта 1969 — назначен епископом Тульским и Белёвским с оставлением в должности заместителя Председателя Отдела Внешних Церковных Сношений.
18 июня 1971 года за усердные труды по проведению Поместного Собора Русской Православной Церкви 30 мая — 2 июня 1971 года Святейшим Патриархом Пименом удостоен сана архиепископа.
27 апреля 1972 удостоен сана митрополита.
30 мая 1972 решением Святейшего Патриарха и Священного Синода назначен председателем Отдела внешних церковных сношений, постоянным членом Священного Синода.
16 апреля 1976, в связи с празднованием 30-летия Отдела внешних церковных сношений, удостоен Святейшим Патриархом Пименом права ношения двух панагий.
11 июня 1977 назначен митрополитом Крутицким и Коломенским, Управляющим Московской епархии, её правящим архиереем (в границах Московской области, за исключением города Москвы), постоянным членом Священного Синода.
19 августа 2002 присвоено звание «Почетный гражданин города Коломны».
25 апреля 2007 вместе с митрополитами Смоленским и Калининградским Кириллом и Калужским и Боровским Климентом совершил чин отпевания первого президента России Б. Н. Ельцина.
3 августа 2007 возглавил делегацию Русской Православной Церкви на похоронах Патриарха Румынского Феоктиста, а 21 марта 2008 — на похоронах Первоиерарха РПЦЗ митрополита Лавра.
По кончине 3 мая 1990 года Патриарха Пимена управлял Московской епархией до интронизации Алексия II, а также по кончине 5 декабря 2008 года Патриарха Алексия II, согласно Уставу РПЦ, управлял Московской епархией до интронизации Патриарха Кирилла.
С 27 июля 2009 года член Межсоборного присутствия Русской Православной Церкви. 29 января 2010 года избран председателем комиссии Межсоборного присутствия Русской Православной Церкви по вопросам взаимодействия Церкви, государства и общества..
С 26 июля 2010 года — член Патриаршего совета по культуре.
10 октября 2010 года за заслуги перед Русской Православной Церковью и в связи с 75-летием со дня рождения удостоен высшей иерархической награды — права преднесения креста за богослужениями в пределах Московской областной епархии.
Резиденция:
Епархиальное управление Московской Епархии Русской Православной Церкви (Московский Патриархат)
Адрес: