Родился в семье крестьянина Антона Дмитриевича Чепиля, погибшего на фронте Великой Отечественной в 1941 году.
В детстве жил в Корецком женском монастыре, послушницей которого была его родная тётя монахиня Манефа, основавшая там златошвейную школу.
В 1955 году, через год после окончания сельской школы, Яков поступил в Киевскую духовную семинарию. В это время начались хрущёвские гонения на церковь и духовенство. В 1957 году, после окончания 3 класса семинарии, Яков был призван в ряды Вооружённых Сил СССР, в стройбат. За время службы окончил строительный техникум по специальности геодезиста в Ставрополе.
После окончания службы, Яков не смог получить паспорт, так как начальство опасалось продолжения его обучения в духовной семинарии. Но документ, свидетельствующий, что он геодезист, и так же обещания работать по специальности помогли ему вернуть паспорт. К этому времени Киевскую семинарию уже закрыли, все документы перевели в Одессу. Яков отправился туда в 1961 году, но получить разрешения от уполномоченного по делам религии не удалось, отказ был мотивирован тем, что семинария находится на грани закрытия. Якову пришлось возвращаться обратно, в Ставрополь, где правящим архиереем был Антоний (Романовский), с которым Яков был знаком ещё со времён воинской службы. Антоний направил его в село Новоселицы Александровского района. Там Яков на протяжении 8 месяцев проходил послушание псаломщика и регента приходской церкви.
В этом же году Яков отправился в Загорск, где поступил в Московскую Духовную семинарию. Но местной прописки ему и ещё нескольким семинаристам, отслужившим в армии не дали, семинария находилась под угрозой закрытия. Лишь после смещения Хрущёва и прекращения гонения на церковь, молодые люди смогли получить прописку.
В 1963—1967 годах Яков обучался в Московской Духовной академии, окончил её со степенью кандидата богословия (работа «Учение Григория Двоеслова о пастырстве»). Во время учёбы в семинарии нёс послушание регента студенческого церковного хора, в академии — регента хоров храмов Москвы.
18 июля 1967 года, в день преподобного Сергия Радонежского, еписковом Филаретом (Вахромеевым) (ныне, митрополитом Минским и Слуцким) был рукоположен в сан диакона. Продолжил обучение в аспирантуре Московской Духовной академии, исполняя при этом обязанности референта Отдела внешних церковных сношений Московского Патриархата.
15 марта 1970 года, после окончания аспирантуры, был рукоположен в сан священника митрополитом Ленинградским и Новгородским Никодимом (Ротовым). 12 сентября 1970 года был назначен настоятелем Каведрального собора Петрозаводска и благочинным церквей Олонецкой епархии.
30 марта 1971 года был пострижен в монашество митрополитом Никодимом с именем Хрисанф. 28 апреля того же года был возведён в сан архимандрита.
23 апреля 1978 года определением Священного Синода РПЦ в Троицком соборе Александро-Невской Лавры в Ленинграде хиротонисан во епископа Кировского и Слободского. Хиротонию совершали: митрополит Ленинградский и Новгородский Никодим (Ротов), архиепископ Выборгский Кирилл и епископы: Тихвинский Мелитон, Вологодский и Великоустюжский Дамаскин, Архангельский и Холмогорский Исидор.
Указом от 9 сентября 1988 года удостоен сана архиепископа.
В 1994 году Вятскую землю посетил патриарх Алексий II. В своём письме Хрисанфу по возвращении в Москву он писал:
29 февраля 2004 года архиепископ Хрисанф был возведён в сан митрополита.
4 января 2011 года митрополит Хрисанф скончался в Москве после тяжелой и продолжительной болезни. Временным управляющим Вятской епархией назначен архиепископ Йошкар-Олинский и Марийский Иоанн (Тимофеев).
9 января 2011 года по благословению Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Кирилла митрополит Хрисанф (Чепиль) был погребен в Успенском кафедральном соборе Трифонова монастыря, у северной стены, недалеко от раки преподобного Трифона Вятского.