Из семьи священника.
Окончил сельскую школу, затем Заиконоспасское духовное училище в Москве. В 1912 году окончил Московскую духовную семинарию, поступил в Московскую духовную академию.
Летом 1915 года, по окончании 3-го курса академии, Сочетался браком с Марией Мирославиной (1896—1938).
8 сентября 1915 года во время обучения в Московской духовной академии рукоположен во диакона епископом Волоколамским Феодором (Поздеевским), а 21 ноября им же во иерея.
В 1916 году окончил Московскую духовную Академию по первому разряду.
1 сентября 1916 года назначен законоучитетем и настоятель домовой церкви при Марфо-Мариинском женском институте в Москве. 1 ноября перемещён на должность 2-го священника в Покровский храм Марфо-Мариинской московской женской обители.
27 марта 1923 году был арестован по обвинению в «использовании религиозных предрассудков масс с целью возбуждения к сопротивлению власти», содержался в Бутырской тюрьме. 16 июня Коллегия ГПУ приняла решение о прекращении следствия за отсутствием состава преступления. Освобождён 24 августа.
В февраль 1927 года в связи с закрытием храмов Марфо-Мариинской обители о. Вениамина переходит на служение в Храм святителя Николая в Пыжах (на улице Большая Ордынка) с возведением в сан протоиерея.
Арестован в ночь с 28 на 29 октября 1929 года по обвинению в «контрреволюционной деятельности», помещён в Бутырскую тюрьму.
В 1930—1931 годах находился в Пересылочном пункте в Архангельске. Там он повстречал ссыльного Серафима Голубцова (1908—1981), знакомого по Сергиеву Посаду. Был отправлен в Шенкурск вверх по течению Северной Двины, а далее по левому притоку реки Ваги.
7 января 1931 года переведён на лесоповал в 60 км от Шенкурска.
В 1934 году выехал из Шенкурска. Из-за невозможности прописаться и устроиться на работу в Загорске переехал в Киржач к Серафиму Голубцову, вошедшему в Катакомбную церковь.
Направлен священником в село Филипповское Киржачского района, служил в селе Волохово (под Струнином) и во открывшейся церкви Святителя Николая в Киржаче.
В июле 1938 года овдовел.
В 1938—1940 годы в связи с отделением от Московского Патриархата Ивановского епископа Алексия (Сергеева) пребывал вне Русской православной церкви. После покаяния принят в церковное общение митрополтом Сергием (Страгородским).
В июле 1943 года вызван митрополитом Сергием в Москву, где получил предложение об архипастырском служении. 23 августа 1943 года Можайским епископом Димитрием (Градусовым) пострижен в монашество с именем Елевферий.
10 октября 1943 года хиротонисан во епископа Ростовского и Таганрогского. Переехал в Ростов-на-Дону с детьми Алексием и Анной с её дочерью.
В сентябре 1943 года участвовал в Архиерейском соборе, избравшем в патриархи митрополита Сергия и отлучившем от Церкви священнослужителей с лишением сана за измену и переход к фашистам.
В 1945 году посетил Харбин, где принял в юрисдикцию Московской Патриархии дальневосточные русские приходы. По окончании Великой Отечественной войны награждён Советским правительством медалью «За трудовую доблесть».
5 апреля 1946 года назначен Экзархом Московского Патриарха в Чехословакии с титулом архиепископа Пражского и Чешского.
26 апреля 1946 года награждён правом ношения креста на клобуке.
В 1948 году возведён в сан митрополита.
28 апреля 1950 года возглавил в Пряшеве Собор представителей греко-католического духовенства и мирян, на котором было принято решение о воссоединении с Русской Православной Церковью.
В 1951 году назначен митрополитом Пражским и всея Чехословакии.
24 апреля 1952 года избран первым доктором богословия Православного Богословского факультета в Прешове. Награждение церковным орденом святых Кирилла и Мефодия первой степени.
С 16 июля по 25 августа 1954 года принимал участие в торжествах по случаю 600-летия Троице-Сергиевой Лавры.
В 1955 году приехал в Москву на лечение в связи с перенесённым инфарктом миокарда.
Осень 1955 года переведён на Ленинградскую кафедру. Переезд с сыном Алексием, диаконом, дочерью Елизаветой с её сыном Сергием (впоследствии протоиереем).
В июле 1956 года награждён Орденом Республики чешским Правительством.
22 октября 1956 года, согласно прошению, освобождён от управления Новгородской епархией.
Скончался 27 марта 1959 года. Погребён в крипте свято-Троицкого собора Александро-Невской Лавры.