Родился 10 февраля 1918 года в посёлке Дедовичи, ныне посёлок городского типа Псковской области в семье рабочего. Русский.
Окончил 7 классов, работал слесарем на молокозаводе, директором Дома культуры.
В Красной Армии в 1939-1940 годах и с 1941 года. Участник советско-финляндской войны 1939-1940 годов. Член ВКП(б) с 1942 года.
Во время Великой Отечественной войны был командиром пулемётного отделения партизанского отряда «Грозный» 2-й Ленинградской партизанской бригады.
С 16 июля 1941 года по 15 марта 1942 года в боях в районе Дедовичи и деревни Городовец лично уничтожил свыше ста оккупантов; вместе с другими партизанами захватил большие военные трофеи. В начале апреля 1942 года провёл через тылы противника в осаждённый Ленинград более двухсот подвод с продовольствием.
Пал смертью храбрых в бою 12 декабря 1942 года.
Похоронен в посёлке городского типа Дедовичи, где сооружён обелиск.
Харченко, Михаил Семёнович на сайте «Герои страны»