Окончил Ленинградский финансово-экономический институт имени Вознесенского (сейчас — Санкт-Петербургский университет экономики и финансов) (1983) по специальности «Экономическая кибернетика». Кандидат экономических наук (1989). Доктор экономических наук (1997; тема диссертации: «Развитие банковского сектора России: теория и методология анализа»).
В 1980-х годах входил в круг ленинградских экономистов-реформаторов, неформальным лидером которых был Анатолий Чубайс; в 1987 году был членом клуба «Синтез» при Ленинградском дворце молодежи, в который входили молодые ленинградские экономисты и обществоведы, среди которых: Дмитрий Васильев, Андрей Илларионов, Борис Львин, Михаил Маневич, Алексей Миллер, Андрей Ланьков, Андрей Прокофьев, Дмитрий Травин и другие.
- В 1983—1990 — научный сотрудник Ленинградского финансово-экономического института.
- В 1990—1993 — народный депутат России, председатель подкомитета, заместитель председателя Комитета Верховного совета России по вопросам межреспубликанских отношений, региональной политики и сотрудничеству.
- В 1993—1994 — член Комиссии законодательных предположений при президенте России.
- В 1994—1995 — заместитель директора Института экономического анализа Андрея Илларионова, член Комиссии по экономической реформе правительства России.
- В 1996—1997 — руководитель экономической программы Московского центра Карнеги.
- В 1997—1998 — первый заместитель министра труда и социального развития России.
- В 1998—2000 — член научного совета Московского центра Карнеги.
- В 2000—2004 — первый заместитель министра экономического развития и торговли России Германа Грефа.
- В июне 2004 — октябре 2005 — научный руководитель фонда «Центр стратегических разработок».
- С октября 2005 — президент фонда «Центр стратегических разработок».
Научные интересы: теоретические и практические проблемы социальных реформ; пенсионная реформа; вопросы реформирования электроэнергетики; проблемы административной реформы.
Труды
- «Социальная политика в период перехода к рынку: проблемы и решения» / Сборник статей (под редакцией А. Ослунда, М. Дмитриева). М.: Московский центр Карнеги, 1996. — 168 с ISBN 0-87003-121-x
- Дмитриев М. Э., Д. Я. Травин Российские банки: на исходе золотого века. — СПб, «Норма», 1996, 143 с.
- «Российские банки накануне финансовой стабилизации» / Науч. ред. М. Э. Дмитриев — СПб.: «Норма», 1996. — 208 с.
- М. Э. Дмитриев «Бюджетная политика в современной России». М.: Московский центр Карнеги, 1997. — 58 с.
- «Пенсионная реформа в России: причины, содержание, перспективы» / Под общей редакцией М. Э. Дмитриева, Д. Я. Травина. СПб.: «Норма», 1998. — 253 с.
- Финансовое состояние и перспективы реформирования пенсионной системы в Российской Федерации // «Пенсионная реформа в России: оценка специалистов» / Под редакцией В. Н. Баскакова, А. С. Орлова. М.: Редакция журнала «Пенсия», 1999.
- «Коммунистическое правительство в посткоммунистической России: первые итоги и возможные перспективы» / Е. Т. Гайдар, С. А. Архипов, С. Б. Баткибеков, М. Э. Дмитриев, С. М. Дробышевский, С. Синельников, В. Б. Ступин, И. В. Трунин, А. Д. Юдин. М.: Институт экономики переходного периода, 1999.
- «Пути стабилизации экономики России» / Сборник под общей редакцией Г. Б. Клейнера. М.: «Информэлектро», 1999; М.: «Экономика», 2000 ISBN 5-7801-0142-6 (один из авторов).
- «Фискальная политика и управление государственным долгом» / Сборник. М: ЦЭМИ РАН, 2000 (один из авторов).
- Party Economic Programs and Implications // Primer on Russia’s 1999 Duma Elections. Washington. 1999 (co-autor).
- Russia after Communism. Washington. 1999.
- М. Н. Дмитриев, Д. В. Помазкин, О. В. Синявская, А. Столяров Russian Economy at the Crossroads: Lessons from the Crisis and Prospects for Sustainable Growth. Warszawa: Center for Social and Economic Research, 2000.
- Transition and Growth in Post-Communist Countries: The Ten-year Experience. Cheltenham (UK), 2001 (co-author).
- Russia’s Post-Communist Economy. Eds. B. Granville, P. Oppenheimer — Oxford University Press, 2001. Глава The Banking Sector написана М. Э. Дмитриевым, М. Ю. Матовниковым, Л. В. Михайловым и Л. И. Сычёвой.
- The Social Crisis in the Russian Federation / OECD 2001 (co-author).