Делит с фехтовальщицей Керстин Пальм, велогонщицей Жанни Лонго, каноисткой Йозефой Идем и конькобежкой и велогонщицей Сейко Хасимото рекорд среди женщин по количеству участий в Олимпийских играх — по 7. При этом Отти — единственная в истории легкоатлетка, участвовавшая в 7 Олимпиадах, и первая спортсменка выбежавшая из 7 секунд на дистанции 60 метров.
Двоюродный брат Мерлин Милт Отти (род. 1959) выступал за Канаду в прыжках в высоту на Олимпийских играх 1984 и 1988 годов (6-е место в 1984 году).
Мерлин Отти родилась 10 мая 1960 года в городке Колд-Спринг на северо-западе Ямайки. Она была четвёртым из семерых детей в семье. Беговые таланты Мерлин проявились ещё в детстве, однако профессионально заниматься лёгкой атлетикой она начала только в 1979 году, когда переехала в США и поступила в Университет Небраски.
Первым большим стартом стали для неё Панамериканские игры 1979 года, где Мерлин Отти выиграла бронзовую медаль на дистанции 200 метров. Годом позже на Олимпийских играх 1980 года в Москве она повторила этот результат на той же дистанции. Поскольку она стала первой женщиной в истории Ямайки, выигравшей олимпийскую медаль, по возвращении на родину она была награждена национальным Орденом Отличия.
Первую победу на больших соревнованиях Отти одержала на Играх Содружества в 1982 году, она победила на двухсотметровке и стала второй на 100 метрах. Олимпийские игры 1984 года в Лос-Анджелесе принесли ей, однако, только две бронзовые медали на обеих дистанциях. В том же году Отти получила университетский диплом бакалавра и вышла замуж за легкоатлета Натаниэля Пейджа (впоследствии брак распался).
Большую коллекцию медалей Отти собрала на чемпионатах мира — в Хельсинки в 1983 серебро (200 метров) и бронза (эстафета 4х100 метров), в Риме в 1987 году бронзовые медали на дистанциях 100 и 200 метров, в Токио в 1991 году снова бронзовые медали на тех же дистанциях и золото в эстафете. В Штутгарте в 1993 году Отти собрала полную коллекцию наград — бронзу в эстафете, серебро на стометровке и долгожданное индивидуальное золото мирового первенства на 200 метрах. На гётеборгском мировом первенстве 1995 года она защитила титул чемпионки мира на 200 метрах и дважды становилась второй — на 100 метрах и в эстафете.
Всего Отти становилась призёром мировых первенств 14 раз, что не удавалось ни одному другому легкоатлету, как среди женщин, так и среди мужчин. Последнюю из этих медалей, бронзовую, Отти получила на чемпионате мира 1997 года в Афинах. Примечательно, что из этих 14 медалей ровно половина — бронзовые.
На Олимпийских играх 1992 года в Барселоне на стометровке Отти показала великолепный результат — 10,86, лучший свой результат в беге на сто метров на Олимпиадах и один из лучших за карьеру. Однако, она заняла только пятое место, поскольку пять лучших спортсменок разделили на финише лишь четыре сотые секунды. Мерлин оказалась последней в этой пятерке. На этой Олимпиаде Отти выиграла лишь одну медаль, и опять бронзовую, на 200 метрах. Эта медаль стала четвёртой олимпийской бронзой Отти при отсутствии медалей более высокого ранга. Такая россыпь бронзовых медалей привело к тому, что спортсменка получила прозвище «Бронзовая королева».
К своим пятым Олимпийским играм в Атланте 1996 года 35-летняя бегунья подошла на пике формы, была безусловной фавориткой на обеих спринтерских дистанциях и была полна решимости наконец завоевать титул олимпийской чемпионки. Фортуна, однако, не благоволила спортсменке. На 100-метровке Отти показала одинаковый результат 10,94 с американкой Гейл Диверс, но фотофиниш присудил олимпийское золото сопернице ямайской бегуньи. На 200-метровке Отти поджидал неприятный сюрприз, на дистанцию заявилась знаменитая француженка Мари-Жозе Перек, чьей специализацией до этого были 400 метров. Перек уверенно победила в финальном забеге, вновь оставив Отти второй. В олимпийской эстафете 4х100 метров ямайская команда стала третьей, Отти получила пятую олимпийскую бронзу.
В период с 1979 по 1997 год Отти 15 раз признавалась в Ямайке лучшей спортсменкой года.
Во время подготовки к шестым для неё Играм в Сиднее допинг-проба Отти показала содержание запрещённого анаболика нандролона. Спортсменке грозила двухлетняя дисквалификация и отлучение от Игр. Сама Отти категорически настаивала на своей невиновности. В результате судебных слушаний Мерлин Отти была полностью оправдана сначала национальной федерацией, а затем и международным арбитражным судом, что позволило ей выступить в Сиднее. Впрочем решение федерации включить без отбора 40-летнюю Отти в олимпийскую сборную вместо более молодой спортсменки Петы-Гайе Доуди, которая завоевала место в команде на национальном первенстве, вызвало шквал критики, в том числе и со стороны ямайских спортсменов, включая коллег Мерлин по эстафете 4х100 метров. Отти, тем не менее, выступила в Сиднее достойно для своего возраста. После дисквалификации американки Мэрион Джонс она стала третьей на 100 метрах (что сделало её самой возрастной легкоатлеткой, добившейся такого успеха) и внесла вклад в серебряный успех эстафеты 4х100 метров. Официально бронзовая награда за 100-метровку Отти пока не присуждена.
После Игр конфликт между Отти и остальной легкоатлетической сборной Ямайки только усугублялся и привёл к тому, что спортсменка заявила «после Сиднея я сказала, что больше не буду бегать за Ямайку … поскольку чувствую, что ямайцы хотять вытолкнуть меня из спорта и я была вынуждена доказывать, что и в 40 лет можно бегать». Поскольку ещё в 1998 году спортсменка переехала жить в Словению к своему тренеру Срджану Джорджевичу, она подала прошение на получение гражданства Словении, которое было удовлетворено в 2002 году. С тех пор Отти выступает за Словению.
В 2004 году главный ветеран мировой лёгкой атлетики соревновался за свою новую родину уже на седьмых своих Олимпийских играх в Афинах. На дистанции 100 метров Отти выбыла на полуфинальной стадии.
После афинских Игр периодически публиковались сообщения о завершении бегуньей своей карьеры, впрочем в 2006 году тренер спортсменки заявил, что она будет готовиться к пекинским Играм. Однако на отборочном турнире в Мариборе Мэрлин пробежала на 0,28 секунды медленнее квалификационного норматива 11,32 секунды. Срджан оправдал это неудачной погодой — встречным ветром.
Летом 2010 года во время чемпионата Европы в Барселоне (где она стала самым возрастным участником в истории этих соревнований) заявила, что не исключает того, что будет пытаться отобраться на Олимпийские игры 2012 года в Лондоне.