Первой серьёзной работой Майкла стала музыка для игры «The Lost World: Jurassic Park», созданной по сюжету одноимённого фильма 1997 года компании DreamWorks. Эта игра стала первой игрой для PlayStation с музыкой, записанной в живую симфоническим оркестром. После этой работы Джаккино продолжил сотрудничество с DreamWorks, написав ко многим популярным видеоиграм музыку для целого оркестра. Джаккино получил награды за музыку к серии компьютерных игр Medal of Honor: Underground, Allied Assault, Frontline, а также к другим играм на тему Второй мировой войны: Call of Duty, Call of Duty: Finest Hour.
Последние несколько лет Майкл не работал над саундтреками к играм, но сейчас он планирует начать работу над музыкой к новой игре о Второй мировой войне: Turning Point: Fall of Liberty.. Кроме того, компания Electronic Arts сообщила о том, что Джаккино вернулся к работе над серией Medal of Honor и написал музыку к игре Medal of Honor: Airborne.
Работа над различными видеоиграми привела Майкла к его первой работе на телевидении. В 2001 году продюсер телесериала Alias Дж. Дж. Абрамс заметил Джаккино благодаря его работам над видеоиграми и попросил его написать саундтрек к новому шоу.. Музыка к сериалу представляет собой смесь симфонической и электронной музыки, что сильно отличается по звучанию от его предыдущих работ.
В 2004 году Майкл получил работу в большом полнометражном фильме студии Pixar Суперсемейка. Режиссёр Брэд Бёрд пригласил Джаккино работать над картиной после того, как услышал его музыку в проекте Alias. Весёлый оркестровый джаз был очень непохож не только на предыдущие работы Майкла, но и на музыку в предыдущих картинах Pixar, которую раньше студия доверяла создавать Рэнди и Томасу Ньюманам. Для работы над Суперсемейкой Брэд Бёрд первоначально пригласил Джона Берри, который отлично известен музыкой к ранним фильмам о Джеймсе Бонде, но Джон, по сообщениям, был не склонен писать музыку для анимационного фильма. В 2005 году Майкл Джаккино за работу над Суперсемейкой был номинирован на две награды Грэмми: Лучший саундтрек и Лучшая инструментальная композиция. Написал музыку к известным телесериалам Fringe (Грань) и LOST (Остаться в живых), и этим прославился.