Марат Минюрович Кулахметов родился в Пензе в семье военнослужащих. По национальности — татарин.
В 1980 году окончил Ленинградское высшее общевойсковое командное училище имени С. М. Кирова и назначен командиром мотострелкового взвода в одну из частей Ленинградского военного округа. Прошёл все командные должности: от командира взвода до командира дивизии.
1991 год — окончил Военную академию имени М. В. Фрунзе.
2001 год — окончил Военную академию Генерального штаба.
2001—2004 — командир 19-й мотострелковой дивизии Северо-Кавказского военного округа.
С сентября 2004 года по октябрь 2008 года — командующий Смешанными силами по поддержанию мира (ССПМ) в зоне грузино-осетинского конфликта, сменив на этом посту генерал-майора Святослава Набздорова.
По состоянию на 20 сентября 2011 года занимает должность советника Министра иностранных дел Российской Федерации.