Начинал карьеру в большом футболе, однако из-за отсутствия в родной Терезине профессиональных футбольных клубов продолжил карьеру в мини-футболе. Играл за клубы «Инстелпи», «Гуарани» и «Оникс». В 1994 году был приглашён в «Тенерифе» — испанский клуб Серебряного дивизиона. Через несколько лет игры в канарском клубе Афранио получил предложение и из Почётного дивизиона и до 2004 года он играл за «МРА» из Памплоны.
В 2004 году бразилец перебрался в российский чемпионат, став игроком «Норильского никеля». А с 2006 года Афранио играет за «Тюмень». В сезоне 2009/10 тюменский клуб впервые в истории выиграл серебряные медали чемпионата России, и во многом это была заслуга 39-летнего бразильца, признанного по итогам первенства лучшим игроком чемпионата.