С 1919 года — профессор Сорбонны, президент Института иранистики (Сорбонна). Член многих академий и научных обществ, иностранный член Академии Наук СССР с 1924 года.
Значимое место в исследованиях Л. Массиньона занимает история мусульманской культуры и мистицизма и сектантства, арабской культуры, философии и лингвистики. Труды учёного основаны на использовании огромного количества источников, в том числе многих, ранее не известных.
Редактировал журнал «Revue de monde musulman»(c 1918 года «Revue des etudes islamiques»).
Среди учеников Массиньона был Анри Корбен.