Второй воевода полка правой руки в Литовских походах 1507—1508 годов. Наместник рязанский 1512—1514, псковский 1514—1519. Первый воевода передового полка в армии брата, Василия Немого в походе на Полоцк в 1519. Наместник смоленский 1520—1523. Первый воевода Большого полка в войске царя в Казанском походе 1523 года. Был во главе боярской комиссии по переговорам с Литвой в 1526 году. С братом во главе войска в походе к Нижнему Новгороду в 1531.
Боярин с 1532. Наместник двинский 1534—1535, во главе Большого полка в Смоленском походе 1535.
Стал наместником московским после смерти брата Василия Немого в ноябре 1538 года.
Иван IV впоследствии с обидой вспоминал: «Нам бо в юности детства играюще, а князь Иван Васильевич сидит на лавке, локтем опершися, отца нашего на постелю ногу положив, к нам же не преклоняяся». В июле 1540 года по настоянию митрополита Иоасафа был освобождён Иван Бельской, а Шуйский отстранён от дел.
В результате успешного заговора 3 января 1542 года Иван Васильевич смог вернуться в Москву, Бельский же был схвачен и отослан в Белоозеро, а в мае — убит. В том же месяце умер и Иван Шуйский.
От брака с некой Авдотьей оставил сыновей Андрея и Петра.