Родился в семье крестьянина. Окончил начальную школу. Работал в совхозе.
С 1942 года — в рядах Красной Армии; с этого же времени — на фронте. С осени 1943 года Аляпкин становится механиком-водителем танка 181-й танковой бригады. В октябре этого же года в бою у населенного пункта Орлово экипаж Аляпкина уничтожил пять пулеметных точек и два противотанковых орудия неприятеля. В ходе сражения танк был подбит, и старшина, не смотря на ранение, вывел машину из боя и спас командира, также получившего ранение.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 10 марта 1944 года за образцовое выполнение боевых заданий командования на фронте борьбы с немецко-фашистскими захватчиками и проявленные при этом мужество и героизм старшине Аляпкину Ивану Матвеевичу присвоено звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали «Золотая Звезда».
После войны демобилизовался. Проживал и работал в Беднодемьяновске. Умер 3 августа 1951 года.