Жена: Мария Ивановна Боговитинова.
Около 1536 года бежал в Литву. Для того чтобы остальные родичи не последовали за Иваном Губкой, с оставшихся Шуйских были собраны поручные записи. Князь Шуйский активно участвовал в 1540-1542 гг. в работе комиссарского суда в Вильно.
Потомки Ивана Губки живут и поныне, но утратили свой княжеский титул.