Иоганн Каспар был сыном Иоганна Кристофа фон Ампрингена и Сюзанны фон Ландсберг.
Иоганн Каспар был Королевским Верховным капитаном Силезии и австрийским губернатором в Венгерском королевстве. С 1664 года он находился в Вене в должности великий магистр Тевтонского ордена, а 12 марта 1665 года официально принимает на себя все права и обязанности магистра. 4 ноября 1682 года получает титул чешского князя, а 10 ноября 1682 — титул князя Империи «князь фон Фройденталь». На должности великого магистра провёл обширную реконструкцию замка ордена Фройденталь.
В 1684 году Иоганн Каспар умирает в Бреслау как последний представитель рода фон Ампринген. Похоронен в орденской кирхе в Фройдентале.