Управлял восточной церковью с 1521 года. Сначала должен был бороться с сильной партией лжепатриарха Иоанникия, затем достиг большого влияния. Когда в 1536 году было решено уничтожить все церкви в городах, взятых силой оружия, Иеремия добился отмены этого постановления по отношению к Константинополю.