Мирская фамилия — Цзя (кит. ?), получил традиционное конфуцианское образование, увлекался даосской литературой. В двадцатилетнем возрасте встретился с Даоанем, со временем стал его любимым учеником. По преданию, в буддийских проповедях удачно применял цитаты из даосских трактатов, что вызывало одобрение Даоаня. В 379—384 годах проповедовал в Цзинчжоу, в 384 (по другой версии — в 381) году поселился в монастыре Дунлинсы в горах Лушань (пров. Цзянси). Переписывался с Кумарадживой.
Агиографическая традиция сообщает о дружбе Хуэйюаня с поэтом Тяо Цянем и даосом Лу Сюцзином (в действительности жившим в 406—477 годах); эта житийная версия легла в основу известного сюжета традиционной китайской живописи «Трое смеющихся друзей».
К школе Хуэйюаня, известной под названием «Общество Белого лотоса» ???/???, восходит наименование средневековой народной религиозной традиции «Белого лотоса». Согласно ряду учёных, заимствование ограничилось только названием: Хуэйюань проповедовал медитацию и обращался преимущественно к элитным кругам, в то время как его "последователи" выступали за мантрическое повторение имени будды Амитабхи и принадлежали к более низким слоям общества.