В феврале 2007 года перешёл из уругвайского «Дефенсор Спортинга» в «Вильярреал», однако за этот клуб в чемпионате Испании не играл. Свой дебютный сезон в испанской Примере провёл на высоком уровне, находясь в аренде в клубе «Рекреативо» из Уэльвы. Своей игрой Касерес привлёк к себе внимание скаутов «Челси», мадридского «Реала» и других топ-клубов Европы.
4 июня 2008 года Касерес подписал контракт с «Барселоной» на четыре года. Его трансфер из «Вильярреала» обошёлся каталонскому клубу в ? 16 млн, сумма выкупа контракта составила ? 50 млн.
30 июля 2009 года каталонская «Барселона» и туринский «Ювентус» договорились об аренде молодого уругвайского дарования на один год с последующим правом выкупа за 11 миллионов евро, которым «Ювентус» не воспользовался, посчитав сумму завышенной.
30 августа 2010 года Касерес присоединился к «Севильи» на правах аренды с опцией последующего выкупа по окончанию сезона.
31 мая 2011 года «Севилья» согласовала с «Барселоной» сделку о подписании Касераса на постоянной основе.
25 января 2012 года «Севилья» после долгих переговоров согласилась отдать уругвайца в аренду в туринский «Ювентус» за 1.5 миллиона евро с правом первоочередного выкупа его контракта за 8 миллионов по окончании сезона. Большое влияние на согласие руководителей испанского клуба оказало желание самого футболиста выступать за Туринский клуб в котором он ранее выступал.