Принят из английской службы на русскую в 1783 году с чином мичмана с назначением в Донскую флотилию. В следующем году Белли был произведен в чин лейтенанта.
Во время второй турецкой войны Белли, командуя шхуной «Победослав-Задунайский», участвовал в сражении с турецким флотом при острове Федониси (3 июля 1788 года).
В 1790 году назначен командиром репетичного фрегата «Полоцк» в эскадру контр-адмирала Ф. Ф. Ушакова с которой участвовал в сражениях в Керченском проливе (8 июля 1790 года), у Гаджибея (28 и 29 августа 1790 года) и у мыса Калиакрии (31 июля 1791 года). За отличие, оказанное в последнем сражении, Белли был награжден орденом св. Владимира 4 степени с бантом.
Командуя 32-пушечным фрегатом «Счастливый», Белли участвовал в экспедиции Ушакова 1798—1800 годов в Архипелаге, для освобождения Ионических островов из-под власти французов. В эту экспедицию Белли был при овладении островами Чериго и Занте и при блокаде крепости Корфу, за что был награжден орденом св. Анны 2 степени.
Произведенный в капитаны 2-го ранга, Белли 8 мая 1799 года высадился с отрядом из 511 матросов и 6-ю пушками на итальянский берег в заливе Манфредонии для подавления республиканской партии. 11 мая овладел городом Фоджио и двинулся далее сухим путем прямо к Неаполю, восстанавливая везде королевскую власть. Получая с наших судов подкрепления для своего отряда, Белли победоносно подошел к столице, вытеснил из нее французский отряд, укрывавшийся в крепости Сант-Эльмо, и овладел Неаполем 3 июня. За взятие Фоджио, Белли пожалован был орденом св. Иоанна Иерусалимского, а за взятие Неаполя награжден орденом св. Анны 1 степени. Продолжая затем на своем фрегате крейсерство, Белли овладел крепостями Кастель-Нуово и Капуей 17 июля, потом возвратился к Неаполю и оставался в нем два года.
В 1804 году, в чине капитана 1-го ранга командуя кораблем «Азия», Белли вторично перешел в Архипелаг и крейсировал в Средиземном море. Со времени прихода в Архипелаг из Кронштадта эскадры под флагом вице-адмирала Сенявина, Белли принял участие в очищении от французов приморских пунктов в Адриатике.
В 1806 году Белли овладел провинцией Боко-ди-Каттаро в Черногории, городом и крепостью Курцало 30 марта и островом Лисса; потом участвовал при блокаде острова Патраса и, приняв в командование взятый в плен в Афонском сражении корабль «Сед-эль-Бахр», привел его из Корфу в Триест.
В 1808 году, в чине капитан-командора, по случаю начавшейся войны с Англией, Белли был отозван берегом в Россию и до 1812 года проживал в Москве, Санкт-Петербурге и Саратове.
В 1812—1826 годах Белли продолжал службу в Черноморском флоте и, большею частью, состоял в Севастополе, командуя сперва 59-м флотским экипажем, а с производством в чин контр-адмирала в 1816 году, он получил в команду 3-ю бригаду Черноморского флота.