Свою карьеру он начал в качестве журналиста в родном Миннеаполисе. В 1907 году он стал управляющим кинотеатра в городке Миссула в Монтане, а позже получил работу на киностудии «Path?». К началу карьеры в качестве продюсера в 1921 году, Куимби добился больших успехов на киностудии, став одним из членов совета директоров. В 1924 году его на работу взяла киностудия «Fox», а в 1927 году Куимби перешёл на «MGM», где стал главой отдела развития. В 1937 году он был назначен руководителем отдела анимации, созданным на «MGM» в том же году.
В 1939 году Уильям Ханна и Джозеф Барбера предложили ему экранизировать свою серию карикатур о похождения кота и мыши, что привело к появлению эпизода «Кошечка Получает Пинок», ставшего первым в серии мультипликационных фильмов «Том и Джерри». К тому же данный эпизод получил номинацию на премию «Оскар». В дальнейшем Фред Куимби ещё пять раз номинировался на премию Американской киноакадемии и семь раз становился её обладателем. В 1955 году он ушёл из «MGM», а спустя год студийная анимационная студия была закрыта, вместе с чем завершился и показ мультсериала «Том и Джерри». Фред Куимби умер в Санта-Монике в 1965 году в возрасте 79 лет.