Дебютировал в феврале 1998 года.
В январе 2001 года состоялся бой двух непобеженных проспектов — Фрайдея Ахунаньи и Сергея Ляховича. Белорус с небольшим преимуществом переигрывал нигерийца. По окончании боя единогласным решением судей победителем был объявлен Ляхович. Поединок проходил в рамках шоу, организованного телеканалом HBO, главным событием которого был 2-й бой Леннокс Льюис — Хасим Рахман.
В марте 2004 года Ахунанью нокаутировал Лэнс Уитакер.
В марте 2005 года Ахунанья проиграл Таурусу Сайксу.
В апреле 2005 года Фрайди Ахунанья встретился с Домиником Гуинном. После 10 раундов судьи объявили ничью. Неофициальный судья телеканала ESPN Тэдди Атлас посчитал, что победил с разгромным счетом Гуинн.
В сентябре 2005 года нигериец проиграл встретился с Султаном Ибграгимовом. Бой остановили в 9-м раунде из-за рассечения, вызванного столкновением головами. По очкам победил Ибрагимов.
В марте 2006 года состоялся бой между Фрайдеем Ахунаньей и россиянином Александром Поветкиным. Начало боя было за россиянином, однако к концу поединка он стал уставать. Так как бой был 6-раундовым, то Поветкин сумел сохранить преимущество, и победил единогласным решением судей. Ринганнонсер не огласил счет, сообщив лишь, что победил россиянин.
В ноябре 2007 года Ахунанья отправился в Новую Зеландию на бой против местного непобежденного проспекта Шейна Кэмерона. Кэмерон вел по очкам. К концу боя его лицо стало избитым. В 12-м раунде Ахунанья пробил левый апперкот, которым потряс противника, и сразу же правым крюком отправил его на настил. Кэмерон встал на счет 6. У него текла слюна, а лицо все было в крови. Он был потрясенным, но рефери позволил бой продолжить. Ахунанья сразу же провел двойку, и Кэмерон вновь упал. Рефери остановил бой. «Абсолютное бедствие» (absolutly disaster) — сказали сразу же комментаторы Новозеландского телевидения.
В июне 2008 года Фрайдей Аханунья вышел на ринг против непобеждённого американца Алонсо Батлера. Нигериец был более активен, и точен в ударах. По окончании 10-ти раундов судьи единогласным решением отдали победу Ахунанье.