Учился в Париже и посвятил себя изучению анатомии в связи с физиологией. Находясь на должности прозектора на медицинском факультете, а будучи врачом в госпитале Hotel Dieu, он в 1831 стал профессором и в Coll?ge de France. Он был одним из самых блестящих представителей экспериментального направления в физиологии и был в своё время первым вивисектором, в высокой степени усовершенствовавшим и подвинувшим вивисекционную технику.
Своими трудами оживил экспериментальную физиологию, в особенности подтверждением закона Белла о различии функций передних и задних корешков спинного мозга. Из его школы вышел знаменитый физиолог Клод Бернар.
Мажанди напечатал: