Родился 14 мая 1922 года в Велико Трговишче.
В 1941 году с отличием окончил гимназию.
Во время Второй мировой войны вступил в югославскую компартию и Народно-освободительную армию.
Уволился из вооруженных сил в 1961 в чине генерала армии, стал директором загребского Института истории рабочего движения. Защитил докторскую диссертацию в Загребском университете в 1965 году.
Дважды подвергался тюремному заключению по обвинению в поддержке национализма, первый раз в 1972 году, второй раз в 1981 году, был лишён всех наград.
При поддержке хорватских эмигрантов основал партию Хорватское демократическое содружество (Hrvatska Demokratska Zajednica), победившую на выборах 1990 года и остававшуюся правящей вплоть до конца 1999 года.
Туджман избирался парламентом на пост президента Хорватии в 1990 году и был переизбран на прямых выборах в 1992 году.
В том же 1992 году Туджману было присвоено звание почётного гражданина Загреба.
В 1995 году в результате проведённых операций «Молния» и «Буря» с территории ликвидированной Республики Сербская Краина бежало 230—250 тысяч сербов. 21 ноября того же года подписал Дейтонское соглашение от Хорватии.
Несмотря на плохое состояние здоровья, был переизбран на третий срок в июне 1997 года.
В 1999 году у Туджмана был диагностирован рак желудка. После госпитализации 26 ноября передал на 2 месяца свои полномочия спикеру парламента Влатко Павлетичу. Умер 10 декабря того же года.
Похоронен на городском кладбище Мирогой.
Объекты, названные в честь Франьо Туджмана: